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Dividir multifasta

Buenos días,

soy nueva -nuevísima- en esto de la Bioinformática y no me aclaro, por eso he decidido que igual me viene bien algo de ayuda. He estado echando un ojo a otros hilos en los que se ha hablado de dividir multifasta pero no se acoplan a lo que necesito.

La idea es que a partir de un multifasta del que no conozco cuántas secuencias hay, me divida todas las secuencias únicas y me ...
Read more : Dividir multifasta | Vistas : 1571 | Respuestas : 1 | Foro : Bioinformática


Problema Usando Net::Telnet::Cisco

Cordiales saludos perleros.

Tengo problemas para capturar la salida que se genera después de cada comando, a continuación relaciono parte del script que estoy usando:


@conn1 = conectar_telnet_cisco( $IPDEVICE, $userbackups, $passbackups );
if ( ( $conn1 ) ) {
$mensajeerror .= "Equipo=$DEVICE, IP=$IPDEVICE, INTERFACE=$INTERFACE, ERROR=$conn1\n<br>";
$conteoerrores++;
}
else {
@out = $conn1->cmd("configure terminal\n");
@out = $conn1->cmd("interface $INTERFACE\n");
@out = $conn1->cmd("shutdown\n");
@out = $conn1->cmd("exit\n");
@out = $conn1->cmd("exit\n");
sleep(10);
@out = $conn1->cmd("write memory\n");
sleep(10);

$comando ...
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Cómo obtengo varias filas de mi DB

Hola amigos, ¿cómo están? Quiero saber cómo puedo obtener varias filas desde una consulta MySQL en Perl.

Tengo el siguiente código:

sub store :Local :Args(0) {
my ($self, $c) = @_;

# connect to the database
my $dbh = DBI->connect("DBI:mysql:database=datatest", "perltestUser", "password")
or die $DBI::errstr;

# query a la tabla
my $statement = qq{SELECT * FROM staff};

my $sth = $dbh->prepare($statement)
or die $dbh->errstr;

$sth->execute()
or die $sth->errstr;

my ($query_store) = $sth->fetchrow_array;

my ...
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Pregunta de novato

Amigos, tengo este código:


__PACKAGE__->meta->make_immutable;

package Result;

sub new {
my $class = shift;
my $self = bless {
'error' => shift,
'message' => shift,
'userid' => shift
}, $class;
return $self;
}


¿Me podrían explicar las diferencias entre __PACKAGE__-> y package Result?

¿Y me podrían explicar bien para qué se usa el bless()? No encuentro una definición certera por ningún lado.
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GitPrep v1.9, clónico de GitHub

Ha salido la versión v1.9 de GitPrep, una aplicación que es un clónico de GitHub: permite crear un pequeño GitHub en tu propia máquina UNIX/Linux.

Anuncio (en inglés)
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JSON con Catalyst, en Perl

Buenas, aprovecho que tengo un tiempo libre para hacer varias preguntas respecto a JSON en Perl ya que el proyecto que vamos a comenzar en el trabajo es un proyecto Web.

Tengo un servidor de prueba en Catalyst (Web framework para Perl) creado directamente de un tutorial de ellos donde se explica también el concepto de MVC aplicado al servidor a través de scripts de Perl. El tema es que nosotros para ir aprendiendo un ...
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Versiones de Perl en programas viejos

Hola amigos, ¿cómo va? Este es mi primer mensaje en el foro.

Les cuento que estoy aprendiendo Perl a causa de un cambio de proyecto en mi trabajo. Yo venía de COBOL y la verdad que Perl es un mundo totalmente nuevo.

El tema es que estamos por arrancar un proyecto con un cliente importante el cual tiene un sistema de venta de tiques en Perl.

La cuestión es que este sistema tiene alrededor de ...
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Cómo leer un archivo CSV guardado en servidor

Estimados:

Un gusto saludarles, mi nombre es Alex y les comento que estoy trabajando con un sistema OTRS, por lo cual necesito realizar un módulo personalizado dentro de OTRS.

Pero hasta el momento es mi primer vez que veo este lenguaje y no tengo muy claro cómo hacerlo. Lo que tengo es lo siguiente.

Ambiente: máquina virtual de Amazon con CentOS 6.5.

1. Di permisos al cgi-bin y creé una plantilla con la interfaz del ...
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