getorf
Publicado: 2008-07-23 04:45 @239
Hola.
Estoy trabajando con un fichero en formato fasta que contiene una secuencia de ADN. Tengo que extraer los distintos orf posibles entre los codones de inicio y de fin desde los 6 marcos de lectura posibles. Mi problema es que en el fichero de salida me salen todas las secuencias posibles excepto la última de la lectura normal y la última de la cadena inversa. No sé si será un error de contadores o de qué pero no soy capaz de sacarlo.
Un saludo.
Gracias.
Estoy trabajando con un fichero en formato fasta que contiene una secuencia de ADN. Tengo que extraer los distintos orf posibles entre los codones de inicio y de fin desde los 6 marcos de lectura posibles. Mi problema es que en el fichero de salida me salen todas las secuencias posibles excepto la última de la lectura normal y la última de la cadena inversa. No sé si será un error de contadores o de qué pero no soy capaz de sacarlo.
Un saludo.
Gracias.