Crear multisecuencias
Publicado: 2011-12-10 21:54 @954Estimado explorer:
Tengo un problema con respecto a la permutación de secuencias nucleotídicas. Por ejemplo:
Tengo 3 secuencias nucleotídicas o aminoácidos.
INPUT
>multisecuencia
acgtc tgatgc gcatcg
(pueden ser de diferente tamaño y estar en un mismo archivo o en archivos distintos, en formato fasta)
Ahora, necesito realizar la permutación de dicha secuencias, en este caso sería 3!=3x2x1, teniendo lo siguiente:
OUTPUT
>multisecuencia
acgtc tgatgc gcatcg ..... seq1
tgatgc acgtc gcatcg ..... seq2
tgatgc gcatcg acgtc ..... seq3
acgtc gcatcg tgatgc ..... seq4
gcatcg acgtc tgatgc ..... seq5
gcatcg tgatgc acgtc ..... seq6
Espero tu respuesta. Además debo agradecer las anteriores respuestas. Espero que sigas comentado la solución en forma didáctica. Es muy bueno porque se aprende mucho más. Bien si pudieras recomendarme un libro; te lo agradecería.
¡¡¡Saludos!!!
Tengo un problema con respecto a la permutación de secuencias nucleotídicas. Por ejemplo:
Tengo 3 secuencias nucleotídicas o aminoácidos.
INPUT
>multisecuencia
acgtc tgatgc gcatcg
(pueden ser de diferente tamaño y estar en un mismo archivo o en archivos distintos, en formato fasta)
Ahora, necesito realizar la permutación de dicha secuencias, en este caso sería 3!=3x2x1, teniendo lo siguiente:
OUTPUT
>multisecuencia
acgtc tgatgc gcatcg ..... seq1
tgatgc acgtc gcatcg ..... seq2
tgatgc gcatcg acgtc ..... seq3
acgtc gcatcg tgatgc ..... seq4
gcatcg acgtc tgatgc ..... seq5
gcatcg tgatgc acgtc ..... seq6
Espero tu respuesta. Además debo agradecer las anteriores respuestas. Espero que sigas comentado la solución en forma didáctica. Es muy bueno porque se aprende mucho más. Bien si pudieras recomendarme un libro; te lo agradecería.
¡¡¡Saludos!!!