Obtener rango de secuencia
Publicado:
2014-02-25 09:57 @456por zackarias
Hola,
Tengo varias secuencias en formato fasta, la cabecera es de este tipo:
>scaffold_4 [2363803....2366069]
¿Cómo puedo obtener con una expresión regular los dos números?
Saludos
Re: Obtener rango de secuencia
Publicado:
2014-02-25 13:28 @603por Aceitunas
Using perl Syntax Highlighting
use feature 'say';
my $cadena = ">scaffold_4[2363803....2366069]";
$cadena =~ />scaffold_4\[(\d\d\d\d\d\d\d)\.\.\.\.(\d\d\d\d\d\d\d)\]/;
say "Primer número $1";
say "Segundo número $2";
Coloreado en 0.004 segundos, usando
GeSHi 1.0.8.4
En la página tienes algunos
tutoriales sobre expresiones regulares:
http://perlenespanol.com/tutoriales/exp ... regulares/Además, si tienes tiempo de mirar algunos temas donde hay dudas sobre ellas aprendes mucho
search.php?keywords=expresiones+regulares
Re: Obtener rango de secuencia
Publicado:
2014-02-25 16:40 @736por explorer
Hay un ejemplo en el código del mensaje
Contar repeticiones secuencias de bases.