Edición en columna de tabla
Publicado: 2016-09-06 13:12 @592
Hola chicos:
Espero alguien me pudiera ayudar para editar la información de una tabla mediante línea de comandos ya que soy nuevo en esto.
La tabla que tengo presenta la siguiente información en el .txt adjunto.
En la columna de logFC se expresa el nombre del gen pero es demasiado largo y quisiera solo trabajar con el GeneID.
Por ejemplo, de
Dbxref=GeneID:105370384;Name=LOC105370384
Dbxref=GeneID:128869,HGNC:HGNC:15791,HPRD:12250,MIM:608528;Name=PIGU
quisiera mantener en esa columna solo 105370384 y 128869
manteniendo los valores e información del resto de columnas de mi tabla.
Archivo de ejemplo:
Espero alguien me pudiera ayudar para editar la información de una tabla mediante línea de comandos ya que soy nuevo en esto.
La tabla que tengo presenta la siguiente información en el .txt adjunto.
En la columna de logFC se expresa el nombre del gen pero es demasiado largo y quisiera solo trabajar con el GeneID.
Por ejemplo, de
Dbxref=GeneID:105370384;Name=LOC105370384
Dbxref=GeneID:128869,HGNC:HGNC:15791,HPRD:12250,MIM:608528;Name=PIGU
quisiera mantener en esa columna solo 105370384 y 128869
manteniendo los valores e información del resto de columnas de mi tabla.
Archivo de ejemplo:
Using text Syntax Highlighting
- logFC logCPM PValue FDR IND.10.N.3_GCF NOTRAT.1_GCF IND.10.N.3_GCF NOTRAT.1_GCF DE Regulation
- Dbxref=GeneID:105370384;Name=LOC105370384 953 516 0.885105148 437 0.904246783 437.0008964 953 516 44.79746355 31.18396657 90.42
- "Dbxref=GeneID:128869,HGNC:HGNC:15791,HPRD:12250,MIM:608528;Name=PIGU" 940 506 0.893523372 434 0.904221549 434.0009198 940 506 44.18637538 30.57962613 90.42
- "Dbxref=GeneID:55501,HGNC:HGNC:17423,HPRD:13056,MIM:610129;Name=CHST12" 416 212 0.972519264 204 0.904208933 204.0023181 416 212 19.55482144 12.81201727 90.42
- "Dbxref=GeneID:116285,HGNC:HGNC:18049,MIM:614357;Name=ACSM1" 851 455 0.903292587 396 0.904196316 396.0010302 851 455 40.00277175 27.4974899 90.42
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