Archivo multifasta
Publicado: 2017-10-13 06:49 @325
Buenos días.
Partimos de un archivo de texto con cadenas de DNA en formato FASTA:
Y queremos que nos devuelva el ID de la cadena con el porcentaje de CG más elevado, éste incluido.
La salida sería:
¿Alguien sabría cómo hacerlo?
Gracias.
Partimos de un archivo de texto con cadenas de DNA en formato FASTA:
Using text Syntax Highlighting
>Rosalind_6404
CCTGCGGAAGATCGGCACTAGAATAGCCAGAACCGTTTCTCTGAGGCTTCCGGCCTTCCC
TCCCACTAATAATTCTGAGG
>Rosalind_5959
CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCAATTAAGTCCCTATCCAGGCGCTCCGCCGAAGGTCT
ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC
>Rosalind_0808
CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGAC
TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT
CCTGCGGAAGATCGGCACTAGAATAGCCAGAACCGTTTCTCTGAGGCTTCCGGCCTTCCC
TCCCACTAATAATTCTGAGG
>Rosalind_5959
CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCAATTAAGTCCCTATCCAGGCGCTCCGCCGAAGGTCT
ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC
>Rosalind_0808
CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGAC
TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT
Coloreado en 0.000 segundos, usando GeSHi 1.0.8.4
Y queremos que nos devuelva el ID de la cadena con el porcentaje de CG más elevado, éste incluido.
La salida sería:
Using text Syntax Highlighting
Rosalind_0808
60.919540
60.919540
Coloreado en 0.004 segundos, usando GeSHi 1.0.8.4
¿Alguien sabría cómo hacerlo?
Gracias.