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Analizar solo una cadena de genbank

Perl aplicado a la bioinformática

Re: Analizar solo una cadena de genbank

Notapor explorer » 2011-08-01 12:56 @581

Yo no he puesto ningún contador. Me vale con ver el número de líneas que se han generado con el informe de genes solapados.

Si estás en Linux, puedes usar el comando wc -l junto con el nombre de un fichero, para que te diga cuántas líneas tiene.

O poner un contador en el programa...
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Re: Analizar solo una cadena de genbank

Notapor alexander2714 » 2011-08-01 13:37 @609

Tienes toda la razón. Muchísimas gracias por compartir sus conocimientos; son de mucha ayuda y más para personas que en mi caso no tenemos mucha experiencia en estos temas. De nuevo, gracias.
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Re: Analizar solo una cadena de genbank

Notapor alexander2714 » 2011-08-01 14:02 @626

explorer, pasó algo curioso: el total de genes solapados es de 1069, el total de zonas intergénicas es de 3119, pero el total de genes que tengo en mi gb es de 3988.

¿No sé supone que la cantidad de genes solapados que me debió haber dado debería ser de 879? ¿Por qué pasó esto?

¡Gracias!
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Re: Analizar solo una cadena de genbank

Notapor explorer » 2011-08-01 15:20 @681

Sin más pistas, la respuesta es: ni idea.
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