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bioinfo: Extraer secuencias intergénicas de archivos GenBank

Perl aplicado a la bioinformática

bioinfo: Extraer secuencias intergénicas de archivos GenBank

Notapor explorer » 2011-07-25 12:03 @544

«La tarea de hoy consiste en leer un archivo GenBank, por ejemplo de un genoma circular bacteriano, con el fin de extraer las secuencias intergénicas. Para esta tarea vamos a utilizar código de BioPerl y antes necesitaremos descargar al menos un fichero GenBank, como se explica por ejemplo en el taller de (bio)perl. Una vez tengamos los archivos de entrada necesarios, podemos resolver el problema de las secuencias intergénicas con una subrutina como ésta:»

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