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bioinfo: Naïve Bayes con pseudoconteos (Laplace)

Perl aplicado a la bioinformática

bioinfo: Naïve Bayes con pseudoconteos (Laplace)

Notapor explorer » 2014-03-10 11:37 @525

«Hola, tras leer recientemente algunos capítulos del libro Doing Bayesian Data Analysis, que trae todo el código escrito en R, se me ocurrió explorar cómo construir en Perl un clasificador bayesiano ingenuo (Naïve Bayes), del que recuerdo haber leído su aplicación hace tiempo en un trabajo de Beer & Tavazoie para correlacionar secuencias reguladoras en cis y patrones de expresión de genes en levaduras.

Enseguida me crucé con un módulo de CPAN (Algorithm::NaiveBayes) adecuado para entrenar un clasificador en base a observaciones codificadas en forma de vectores de atributos y la clase a la que pertenecen.»

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