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bioinfo: Ordenamiento de resultados de BLAST

Perl aplicado a la bioinformática

bioinfo: Ordenamiento de resultados de BLAST

Notapor explorer » 2010-09-27 14:36 @650

«Un problema con el que me he encontrado recientemente es el de ordenar resultados de BLAST contenidos en diferentes ficheros. Para definir mejor el problema supongamos que tenemos 4 genomas A,B,C y D y queremos comparar, todas contra todas, sus secuencias de proteínas por medio del programa blastp. Una manera de hacerlo sería hacer 4x4 comparaciones por parejas (AA,AB,AC,AD,BA,BB,BC,BD,CA,CB,CC,CD,DA,DB,DC,DD) teniendo en cuenta que la dirección en BLAST normalmente importa.»

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