Quizás tengas que activar la opción $File::Copy::Recursive::CPRFComp, o poner un '/' al final de entrada.
Recuerda que no es necesario escribir
Using perl Syntax Highlighting
$origen1="c:\\interfaz_pagos\\entrada\\AFIRME";Coloreado en 0.001 segundos, usando
GeSHi 1.0.8.4
sino que vale con hacerlo así:
Using perl Syntax Highlighting
$origen1 = "C:/interfaz_pagos/entrada/AFIRME";Coloreado en 0.001 segundos, usando
GeSHi 1.0.8.4
(Windows entiende la barra inclinada de Unix)