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Cuál es el comando para contar un nucleótido

Perl aplicado a la bioinformática

Cuál es el comando para contar un nucleótido

Notapor etzaamg » 2021-10-26 12:24 @558

Usando Perl debo contar el número de citocinas que hay en una secuencia. He utilizado varios ejemplos que he encontrado en este foro para conteo de palabras en un texto pero no me ha dado resultado :(

¡ AYUDA !
etzaamg
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Re: Cuál es el comando para contar un nucleótido

Notapor explorer » 2021-10-26 12:40 @570

Bienvenido a Perl en Español, etzaamg.

Si la secuencia está en una cadena de caracteres, puedes usar un bucle while y la instrucción index() para ir encontrando las citocinas, pero sólo si se componen de secuencias conocidas o son pocas. Sino, es mejor usar expresiones regulares si puedes calcular qué patrones necesitas buscar.

Si muestras algo de código y qué es lo que buscas, podríamos ayudarte un poco más.
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