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Extraer fragmentos de ADN teniendo las coordenadas

Perl aplicado a la bioinformática

Extraer fragmentos de ADN teniendo las coordenadas

Notapor K-lixto » 2011-05-31 13:08 @589

Hola, teniendo un archivo con una secuencia única en formato fasta, y otro archivo tabulado donde dos de sus columnas (las 3 y 4 ) contienen las coordenadas respectivas a cierto elemento dentro de la secuencia del primer archivo, ¿cómo puedo extraer dichas fragmentos de secuencia según sus coordenadas?

Saludos y gracias.
K-lixto
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Re: Extraer fragmentos de ADN teniendo las coordenadas

Notapor explorer » 2011-05-31 15:27 @685

Con la función substr()

En este subforo hay algunos ejemplos que hacen uso de ella.
JF^D Perl programming & Raku programming. Grupo en Telegram: https://t.me/Perl_ES
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