• Publicidad

Interpretar resultados InterProScan

Perl aplicado a la bioinformática

Interpretar resultados InterProScan

Notapor Diego3D » 2013-03-17 01:07 @088

Hola a todos :D

Resulta que de la página oficial de InterProScan descargué un script de un cliente que realiza consultas a dicho servicio. El tema es que esos resultados los necesito pasar a un archivo de anotación que estoy armando.

En la documentación de Perl explican que un objeto del tipo Bio::SeqIO::interpro crea un objeto Bio::SeqFeature::Generic, basado en el archivo XML con los resultados, pero no explican muy bien cómo llevar a cabo esto.

¿Alguien tiene alguna idea de cómo realizarlo?

De antemano, gracias :D
Diego3D
Perlero nuevo
Perlero nuevo
 
Mensajes: 9
Registrado: 2011-12-08 10:58 @498

Publicidad

Re: Interpretar resultados InterProScan

Notapor explorer » 2013-03-20 17:34 @773

Algún enlace para acceder a esa información que comentas, o al script, estaría bien.
JF^D Perl programming & Raku programming. Grupo en Telegram: https://t.me/Perl_ES
Avatar de Usuario
explorer
Administrador
Administrador
 
Mensajes: 14480
Registrado: 2005-07-24 18:12 @800
Ubicación: Valladolid, España


Volver a Bioinformática

¿Quién está conectado?

Usuarios navegando por este Foro: No hay usuarios registrados visitando el Foro y 0 invitados

cron