Foro - Perl en Español

Hola.

Estoy trabajando con un fichero en formato fasta que contiene una secuencia de ADN. Tengo que extraer los distintos orf posibles entre los codones de inicio y de fin desde los 6 marcos de lectura posibles. Mi problema es que en el fichero de salida me salen todas las secuencias posibles excepto la última de la lectura normal y la última de la cadena inversa. No sé si será un error de contadores o de qué pero no soy capaz de sacarlo.

Un saludo.
Gracias.

En estos foros sí que se ha comentado alguna vez sobre el formato fasta. Usa el sistema de búsqueda y busca por esa palabra.

Si no son suficientes, lo recomendable sería publicar todo o parte del código que estás usando.

Hoy ha salido una nueva versión del módulo Bio::Grep. Seguro que te sirve para lo que quieres.