• Publicidad

Programa difícil de nucleótidos

Así que programas sin strict y las expresiones regulares son otro modo de hablar. Aquí encontrarás respuestas de nivel avanzado, no recomendable para los débiles de corazón.

Programa difícil de nucleótidos

Notapor DIEGO H.leon » 2009-01-15 09:02 @418

Hola a todos, alguien me podría escribir cómo sería un programa que tiene que hacer:

Primero tomar una información de un archivo (una cadena de nucleótidos)

Eso se hace con OPEN y más o menos lo tengo claro.

Después tiene que separar esa variable en codones (grupos de tres letras) y hacerlas pasar por un bucle en el que según la tabla de arn-proteínas te dirá qué proteína es la que concuerda con mi codón.

Se hace por expresiones regulares porque algunas proteínas tienen más de un codón que solo varía la última letra pero no soy capaz... A ver si me echáis una mano.

Gracias.
DIEGO H.leon
Perlero nuevo
Perlero nuevo
 
Mensajes: 1
Registrado: 2009-01-15 08:56 @414

Publicidad

Notapor explorer » 2009-01-15 09:20 @431

Bienvenido a los foros de Perl en Español, DIEGO H.leon.

Estaría bien ver el código que estás probando.

En cuanto a sacar información de una secuencia de nucleótidos, por aquí ya hemos hablado en alguna ocasión.

Usa el sistema de búsqueda. Busca por la palabra "codones" y luego por "BioPerl".

Por ejemplo: Extracción de secuencia.
JF^D Perl programming & Raku programming. Grupo en Telegram: https://t.me/Perl_ES
Avatar de Usuario
explorer
Administrador
Administrador
 
Mensajes: 14480
Registrado: 2005-07-24 18:12 @800
Ubicación: Valladolid, España


Volver a Avanzado

¿Quién está conectado?

Usuarios navegando por este Foro: No hay usuarios registrados visitando el Foro y 0 invitados

cron