Hay una manera de confimarlo: edita el archivo CGI.pm. Busca por sub new, que es el método que se ejecuta cada vez que se crea un objeto CGI. Y al principio de ese método pones una línea así:
Using perl Syntax Highlighting
- warn "Creación de un objeto CGI";
Coloreado en 0.003 segundos, usando GeSHi 1.0.8.4
A partir de ese momento, ese texto saldrá en el error.log por cada objeto CGI que se cree (también puedes usar algún otro método de registro). Y estarás seguro de cuántos objetos se crean y cuando.
Entonces, el objetivo es reducir la creación de esos objetos, y si es posible, reducirlos a uno solo. Si es UploadEasy exige ser el primero en ejecutarse, para descargarse los archivos, pues una vez que ha terminado le pides que te dé el objeto CGI que ha usado, y lo reusas para CGI::Application.