Hola,
Tengo varias secuencias en formato fasta, la cabecera es de este tipo:
>scaffold_4 [2363803....2366069]
¿Cómo puedo obtener con una expresión regular los dos números?
Saludos
-
- Publicidad
Obtener rango de secuencia
3 mensajes
• Página 1 de 1
Obtener rango de secuencia
por zackarias » 2014-02-25 09:57 @456
-
zackarias - Perlero nuevo
- Mensajes: 11
- Registrado: 2011-09-27 19:33 @856
Publicidad
Re: Obtener rango de secuencia
por Aceitunas » 2014-02-25 13:28 @603
Using perl Syntax Highlighting
- use feature 'say';
- my $cadena = ">scaffold_4[2363803....2366069]";
- $cadena =~ />scaffold_4\[(\d\d\d\d\d\d\d)\.\.\.\.(\d\d\d\d\d\d\d)\]/;
- say "Primer número $1";
- say "Segundo número $2";
Coloreado en 0.003 segundos, usando GeSHi 1.0.8.4
En la página tienes algunos tutoriales sobre expresiones regulares:
http://perlenespanol.com/tutoriales/exp ... regulares/
Además, si tienes tiempo de mirar algunos temas donde hay dudas sobre ellas aprendes mucho
search.php?keywords=expresiones+regulares
Voy a llegar hasta el final, voy a subir la velocidad - Migue Benítez.
- Aceitunas
- Perlero nuevo
- Mensajes: 117
- Registrado: 2013-11-07 15:25 @684
- Ubicación: Ciudad Real, España.
Re: Obtener rango de secuencia
por explorer » 2014-02-25 16:40 @736
Hay un ejemplo en el código del mensaje Contar repeticiones secuencias de bases.
JF^D Perl programming & Raku programming. Grupo en Telegram: https://t.me/Perl_ES
-
explorer - Administrador
- Mensajes: 14486
- Registrado: 2005-07-24 18:12 @800
- Ubicación: Valladolid, España
3 mensajes
• Página 1 de 1
¿Quién está conectado?
Usuarios navegando por este Foro: No hay usuarios registrados visitando el Foro y 0 invitados