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bioinfo:Valida con Travis tu código en un repositorio GitHub

Perl aplicado a la bioinformática

bioinfo:Valida con Travis tu código en un repositorio GitHub

Notapor explorer » 2021-01-28 07:45 @364

Hola,
tras escuchar un par de charlas en la London Perl Conference 2019 (vídeos aquí) tenía pendiente agregar una validación por integración continua a uno de nuestros repositorios en GitHub. Opté por Travis, aunque otra buena opción si empiezas de cero es https://about.gitlab.com

Para qué sirve esto? Pues para no romper nada en bases de código que ya tienen un cierto tamaño cuando haces cambios a lo largo del tiempo. En mi caso, el repositorio https://github.com/eead-csic-compbio/get_homologues tiene más de 20K líneas de código y acumula actualizaciones (commits) desde noviembre de 2016. Al vincular este repositorio a Travis (https://travis-ci.com/eead-csic-compbio/get_homologues) cada vez que hago un nuevo commit/push se lanza una máquina virtual que hace una batería de tests y me informa si va todo bien o si algo se ha roto.

Es sencillo, debes seguir estos pasos:

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