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bioinfo: Dependencias del sistema de un módulo Perl

Perl aplicado a la bioinformática

bioinfo: Dependencias del sistema de un módulo Perl

Notapor explorer » 2021-09-16 15:01 @667

Hola,

un problema con el que tropecé recientemente al preparar un fichero .travis.yaml para un repositorio en GitHub es que algunos módulos Perl pueden fallar al ser instalados porque dependen de software adicional que no está instalado en el sistema operativo. La solución pasa por instalar esas dependencias antes de los módulos en cuestión, tal como se hace por ejemplo con libgd-dev en https://github.com/eead-csic-compbio/ge ... travis.yml

En esta entrada lo que quería compartir es el módulo CPAN-Plugin-Sysdeps, que sirve precisamente para averiguar qué dependencias del sistema tiene cualquier módulo. Un ejemplo vale más que mil palabras:

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