Bien, el script no tiene problemas, salvo quizás que está haciendo referencia a actualiza2.pl de forma relativa y eso puede provocar después que no lo encuentre.
Pero vuestro problema es que no ejecuta actualiza.pl. Es un CGI y como tal hay que ejecutarlo.
Debéis configurar Apache2 para que los pueda ejecutar. Editad la configuración del servidor y buscar la sección relativa a los CGI. Si está comentada, descomentarla. Fijaros también en: qué parte de disco duro hay que instalar los cgi y bajo qué directorio virtual hay que invocarlos.
Por ejemplo, en mi servidor los scripts cgi se colocan en el directorio /usr/lib/cgi/ y se invocan de la forma:
http://www.midominio.com/cgi-bin/script.plHay que mirar también la extensión del archivo que tenga definida para ese directorio. En casi todos los casos se podrá poner como .pl y/o .cgi.