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«Los ficheros PDB (Protein Data Bank) contienen las coordenadas espaciales de los átomos de proteínas cuya estructura está resuelta por técnicas de rayos X o resonancia magnética nuclear (RMN).

Hoy veremos como reusar ese código para extraer los átomos deseados de un fichero PDB.»

Artículo

Comentar solamente una ampliación a lo indicado en el artículo: que el ejemplo propuesto se basa en extraer la información usando expresiones regulares, mientras que la forma de resolverlo en un módulo como Bio::Structure::IO::pdb es usando unpack():

debido a que el estándar indica posiciones fijas de los campos.

Es obvio que el uso de unpack() es mucho mejor (más eficiente), sobre todo cuando tenemos que procesar muchas líneas.

También lo hace así el módulo Chemistry::File::PDB.