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La página oficial de Catalyst es un poco más bonita

Puedes utilizar cualquier de los múltiples editores de texto que hay en Debian para editar el código. Yo, por ejemplo, suelo usar joe y el vim. Cada uno tiene sus pros y sus contras (joe es muy simple, rápido y con menú de ayuda, y en vim, tiene infinitas -pero muy arcanas- formas de edición de texto). Si no están instalados, en Debian se pueden instalar fácilmente (si están los repositorios de software bien configurados, claro).

No conozco VirtualBox, pero parece que es fácil configurar VirtualBox para poder compartir los portapapeles del anfitrión y del huesped.

Una vez en Debian, pues depende del entorno que estés manejando. Si es una XTerm o parecida, para pegar el texto podrás usar el botón de en medio del ratón, o intentar usar la combinación del teclado Mayúsculas+Insertar.

Ah, pues eso sí que es una limitación, que no tenga entorno gráfico. Pero siendo Debian, se puede instalar.

Ten en cuenta una cosa: la mayor parte de los desarrolladores en Catalyst solo necesitan un entorno de texto para desarrollar todo el trabajo.

Otra solución: te conectas a la máquina virtual por medio de Putty o de cualquier otro terminal de SSH, y así podrás usar el copiar y pegar de Windows en la propia ventana de Putty.