Este es mi primer mensaje, y nada, deciros...¡¡¡ hola!!!
Estoy comenzando en el mundo de la bioinformática y ya empieza a darme quebraderos con el tema de la programación que por mi carrera biológica apenas he visto. La cuestión es que tengo una secuencia FASTA con su cabecera. He aislado la cabecera siguiendo un
script que he visto en otro mensaje, el cual ¡¡ha venido muy bien!!
Pero ahora con esta información, ¿cómo puedo interpretar un conjunto de líneas para luego meterla en una base datos?, que esa ya será otra historia...
Using text Syntax Highlighting
>642427638 BgramDRAFT_6745 1557..1832(-)(NZ_ABLD01000069) [Burkholderia graminis C4D1M]
>642427639 BgramDRAFT_6746 1921..2019(-)(NZ_ABLD01000069) [Burkholderia graminis C4D1M]
>642427640 BgramDRAFT_6747 280..846(-)(NZ_ABLD01000070) [Burkholderia graminis C4D1M]
>642427641 BgramDRAFT_6748 851..1948(-)(NZ_ABLD01000070) [Burkholderia graminis C4D1M]
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