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La comunidad de programadores en Perl de habla-hispana.

Algoritmo de ordenación Manber-Myers para array de sufijos

En bioinformática (y otros muchos campos), una de las tareas habituales es la búsqueda de una cadena en otra más larga. Saber si está, dónde está, y cuántas más veces aparece.

Aún con los ordenadores más potentes, la simple búsqueda secuencial tiene límites si la cadena donde buscamos es enorme.

Una de las técnicas que se suelen utilizar, para acelerar el proceso de búsqueda, es la llamada Array de sufijos.

Supongamos que tenemos una secuencia ...
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Ejecutar comando externo desde un script de perl en Bugzilla

Hola,

Estoy intentando crear una extensión para Bugzilla. Las extensiones de Bugzilla se programan en Perl.

Nunca había programado en Perl, pero revisando este foro he encontrado varias maneras de ejecutar un comando desde Perl. Cuando uso system() o las comillas invertidas desde un script Perl ejecutado desde la shell de Linux, me funcionan sin problemas. Sin embargo cuando lo ejecuto desde la extensión de bugzilla no funciona, simplemente creo que no hace nada y ...
Read more : Ejecutar comando externo desde un script de perl en Bugzilla | Vistas : 1785 | Respuestas : 2 | Foro : Intermedio


Problema con package

Tengo el siguiente código:


#!/usr/bin/perl
use CGI;
use CGI::Carp qw(fatalsToBrowser);
use Mod_dir::buscar;
#use strict;
#use warnings;
print error;
#print "Content-type: text/html;charset=UTF-8\n\n";


$query = new CGI;
$query->charset('UTF-8');
print $query->header('text/html');
print $query->start_html({-title=>'', -style=>"../../Css/style_formulario.css"});
print $query->startform;
print"<div id=\"buscar\">";
print $query->div({id=>'bBuscar'},($query->submit({class=>'boton', -value=>'Buscar'})));
print $query->div({id=>'cajatext'},($query->textfield({class=>'bus', -name=>'busq'})));
print "</div>";
print $query->end_form;

my $value = $query->param('busq');

my $campo = buscar->new;
if ($value =~ //) {
my @resultado = @{ $campo->busqueda($value) };
print"<div id=\"tablaM\">";
print $query->start_table;
print $query->Tr($query->th( {id=>'tablaSubTitulo'}, ) ...
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system y mutt

Hola, estoy intentando hacer un script en Perl para mandar un email en caso de que el disco alcance un porcentaje de uso determinado.

Uso el comando de sistema "mutt" al que invoco con la orden "system" pero tengo un problema al usarlo dentro del script.

system("mutt -s 'asunto' email\@dominio.com <<< 'texto'")

uso \@ para introducir la arroba, al ser una carácter reservado.
lo he intentado también con variables en lugar de introducir el texto ...
Read more : system y mutt | Vistas : 1031 | Respuestas : 5 | Foro : Básico


Códigos ASCII

Hola. Estaba viendo esta web: http://www.ascii.cl/es/ y quería preguntar si había alguna forma de hacer lo mismo en Perl; me refiero a poner una URL y codificarla como la web dice.

¿ Alguien me puede ayudar ?
Read more : Códigos ASCII | Vistas : 636 | Respuestas : 1 | Foro : Básico


Nueva versión de Rakudo Star, la 2012.01

Ayer se anunció la salida de la nueva versión de Rakudo Star, distribución que incluye Rakudo -implementación de Perl 6 basado en la máquina virtual Parrot-, el propio Parrot, y algunos módulos, documentación y otros recursos ofrecidos por la comunidad Perl 6.

Estas son las mejoras de esta nueva versión:

  • Se ha mejorado mucho la velocidad de muchas áreas. Para algunas programas, esta versión ofrece un orden de magnitud de mejora en la ...
Read more : Nueva versión de Rakudo Star, la 2012.01 | Vistas : 1500 | Respuestas : 0 | Foro : Noticias de Perl


Agrupar los codones de cada aminoácido

Hola, buenas noches. Estoy haciendo un programa con Perl pero hay algo que me impide avanzar. Necesito hallar las frecuencias de cada aminoácido con una fórmula pero para ello he de utilizar los codones que codifican dicho aminoácido y no sé cómo seleccionar sólo esos y no todos. Tengo hecho un código pero creo que está mal porque no me da la cifra que quiero. Estaría sumamente agradecido si me ayudan.

my $a;
my ...
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Cómo instalar IO-Socket-SSL

Hola, ando queriendo instalar IO-Socket-SSL en mi Windows Seven y no sé cómo instalarlo.

Lo estoy intentando con

http://archive.apache.org/dist/perl/win ... et-SSL.ppd

Pero el error es este:

ppm install failed: Can't find any package that provide Net_SSLeay.pm for IO-Soc
ket-SSL


Y el problema es que el módulo que pide ya lo había instalado de la siguiente forma sin problemas.

ppm install http://archive.apache.org/dist/perl/win ... eay.pm.ppd ...
Read more : Cómo instalar IO-Socket-SSL | Vistas : 1903 | Respuestas : 1 | Foro : Módulos


Realizar conexión con POP3 SSL

Estoy buscando alguna forma de hacer una conexión POP3 SSL al puerto 995.

Encontré esto: http://www.example-code.com/perl/pop3_ssl.asp pero necesito otra alternativa.

También intente con el módulo http://search.cpan.org/~gbarr/libnet-1.22/Net/POP3.pm pero no sé cómo hacer la conexión POP3 SSL al puerto 995.

¿ Alguien puede ayudarme ?
Read more : Realizar conexión con POP3 SSL | Vistas : 1047 | Respuestas : 6 | Foro : Básico


Funciones redefinidas

Hola. Me gustaría que alguien pudiera ayudarme con un problema que me ha surgido de repente y que antes no me pasaba. Resulta que cuando creo el .exe de mi programa y lo ejecuto, cuando le doy a un botón que me comprueba si las direcciones URL están activas, es decir, si se cargan correctamente, me dice los siguientes errores que antes no me pasaba. Cuando he mirado la documentación del módulo , me dice ...
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