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News News of Foro - Perl en Español

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La comunidad de programadores en Perl de habla-hispana.

bioinfo: más one-liners Perl

Hola,
antes de que se acabe el año aprovecho para compartir con vosotros un excelente tutorial de one-liners de Perl, esos comandos que en una línea permiten ejecutar complejas operaciones en el terminal de Linux, el símbolo del sistema de Windows, o, mejor aún, desde dentro de una ventana de MobaXterm.

Artículo
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bioinfo: Secuencia de referencia para experimento TagSeq

Hola,
cada vez se van publicando más trabajos donde se emplea TagSeq, una versión low cost de RNAseq que se especializa en secuenciar el máximo número de transcritos posibles, pero sólo unos cuantos cientos de bases de su extremo 3', contando desde la cola poliA.

Cuando obtenemos lecturas o reads de este tipo y las queremos alinear contra los transcritos anotados del genoma de referencia puede ser útil, con vistas a posibles normalizaciones posteriores que ...
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bioinfo: SOAP interface of footprintDB

Hi,
this entry shows how to query footprintDB from a Perl script.
First, make sure you have module SOAP::lite, which you can install with: $ sudo cpan -i SOAP::Lite. The following Perl5 code shows how to make all dna, protein and text queries, obtaining XML output in all cases.
Note that if you register you can query also your private databases (see details in documentation). Also note that protein searches are time consuming, and if ...
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Nuevo curso de Raku

En https://course.raku.org/ tenemos disponible un curso con preguntas y ejercicios, para aprender Raku.

De momento, ya está disponible el primer tema.

A Complete Course of the Raku programming language

About this course

Part 1. Raku essentials
Basic introduction to Raku and its compiler

What is Raku
Raku vs. Rakudo
How to install Rakudo
Editors and IDEs
Conventional file extensions
Hello, World!
Notes on using Unicode
Running programs
Running from ...
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Recorrer objeto 'Gtk2::TreeIter'

Buenas tardes, foro.

Tengo un objeto de tipo 'Gtk2::TreeIter' y quisiera saber la forma de recorrerlo recursivamente para poder determinar los valores que se guardan dentro.

Ya intenté con Data::Dumper y sólo me tira $VAR1 = bless( do{\(my $o = '94267936158336')}, 'Gtk2::TreeIter' )

Saludos y gracias de antemano.
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Calendarios de adviento 2020

Hoy, día 1 de diciembre, ya están disponibles los calendarios de Adviento de este año.

Otros:
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Array como patrón en expresión regular [Solucionado]

Hola, buenas a todos.

Este es el texto que procesa el script:
<a class="pais" href="">USA</a></td>
<td style="font-weight: bold; text-align:right;background-color:#FFEEAA;">dato USA</td>
<a class="pais" href="">Spain</a></td>
<td style="font-weight: bold; text-align:right;background-color:#FFEEAA;">dato Spain</td>

Pongo el código:

my $i = 0;
my @total = ();

@regexp = (".*pais.*>(.*?)<\/a",".*FFEEAA.*>(.*?)<\/t");

procesar ($texto, \@regexp);

sub procesar{
my ($content,$regexp) = @_;
my @lineas = split "\n" , $content;
my @reg = @{$regexp};
foreach (@lineas){
if($_ =~ m{$regexp->}o){
$total = $1;
$i++; ...
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Array como patron en expresion regular

Hola, buenas a tod@s.

Pongo el código y me explico:
Este es el texto que procesa el script.

<a class="pais" href="">USA</a></td>
<td style="font-weight: bold; text-align:right;background-color:#FFEEAA;">dato USA</td>
<a class="pais" href="">Spain</a></td>
<td style="font-weight: bold; text-align:right;background-color:#FFEEAA;">dato Spain</td>


y este parte del script


my $i = 0;
my @total = ();

@regexp = (".*pais.*>(.*?)<\/a",".*FFEEAA.*>(.*?)<\/t");

procesar ($texto, \@regexp);

sub procesar{
my ($content,$regexp) = @_;
my @lineas = split "\n" , $content;
my @reg = @{$regexp};
foreach ...
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Disponible Rakudo 2020.10

Acaba de salir la versión 2020.10 de Rakudo, la principal implementación del lenguaje Raku (anteriormente conocido como Perl 6).

https://raku.org/

Imagen
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Error al leer un archivo PDF con PDF::API2

Buenas tardes.

Estoy intentado leer un archivo pdf que pesa 44.2 MB. Me genera el siguiente error:

Can't call method "val" on an undefined value at C:/Perl64/site/lib/PDF/API2.pm line 909.

A continuación comparto el código que estoy utilizando para leer el archivo pdf.

use PDF::API2;
use PDF::API2::Page;

$pdfOriginal = PDF::API2->new;
$pdfOriginal = PDF::API2->open($rutaArchivo);

my $count = $pdfOriginal->pages();


La variable rutaArchivo contiene la ruta y el nombre del archivo que se está usando.

Luego estoy ...
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